Le attività di sorveglianza delle aree vulcaniche e simiche e le attività di progetti di ricerca scientifica si avvalgono del supporto di laboratori specialistici, situati presso l'Osservatorio Vesuviano.
In linea generale i laboratori dell'Osservatorio Vesuviano si possono suddividere in laboratori analitici e laboratori tecnologici. I primi, attraverso l'utilizzo di strumentazione avanzata, consentono di condurre studi sperimentali all'avanguardia sulle caratteristiche petrologiche, geochimiche e fisiche di campioni di rocce e fluidi. I laboratori tecnologici sono invece di fondamentale supporto allo sviluppo e manutenzione della strumentazione delle reti di sorveglianza e all'elaborazione di dati cartografici e territoriali con produzione di cartografia tematica.
Laboratorio di Diffrattometria
Laboratorio di Geochimica dei Fluidi
Laboratorio degli Isotopi Radiogenici
Laboratorio di Microscopia Elettronica
Laboratorio di Microscopia Ottica
Laboratorio di Microtomografia ai raggi X
Laboratorio di Spettroscopia all'Infrarosso